مسئله تاخوردگی پروتئین فرآیند پیش بینی ساختار سه بعدی پایدار پروتئین با استفاده از دنباله ی اسیدآمینه های آن است؛ بطوریکه ساختار پیش بینی شده در میان تمام ساختارهای سه بعدی ممکن دارای کمترین سطح انرژی آزاد باشد. به منظور کاهش پیچیدگی محاسباتی مدل های زیادی جهت ساده سازی مسئله پیشنهاد شده است که مدل hp یکی از قدرتمندترین این مدل ها می باشد. حتی در این مدل نیز ثابت شده است که مسئله ی تاخوردگی پرو...

عملکردهای زیستی پروتئین ها به واکنش های شیمیایی آنها با محیط پیرامون و سایر پروتئین ها بستگی دارد. به عبارت دیگر، ساختار سه بعدی و نحوه تاخوردن اجزای پروتئین ها در فضا، چگونگی این تعاملات را تعیین می کند. تشخیص صحیح الگوی تاخوردگی پروتئین با استفاده از اطلاعات استخراج شده از توالی آن، یکی از مسائل پیچیده و بحث برانگیز در زمینه بیوانفورماتیک می باشد. در این پایان نامه، سه روش نوین مبتنی بر الگور...

در این مقاله یک روش طبقه بندی تغییر یافته بر مبنای روش های طبقه بندی بر اساس چگالی برای طبقه بندی تاخوردگی پروتئین ها ارائه شده است که این روش در برابر وجود نویز مقاوم بوده و از سرعت بالایی برخوردار خواهد بود. طبقه بندی پروتئین ها بمنظور پیش بینی عملکرد آنها و شناسایی خواص پروتئین ها یکی از مسائل بزرگ در حوزه طبقه بندی است. با توجه به پیشرفت علم و دستگاه های توالی یابی پروتئین های بسیاری کشف شد...

در حال حاضر رویکرد فزاینده ای به تولید پروتئین های دارویی با استفاده از روش مهندسی ژنتیک وجود دارد. تولید این پروتئین ها در باکتری اشریشیا کلی سبب تشکیل اجسام نامحلول توده ای شکل به نام اینکلوژن بادی می شود. فرآیند تاخوردگی سبب آرایش مجدد پروتئین های واسرشته از اینکلوژن بادی به ساختار اصلی و فعال آن می شود. در خصوص پروتئین های با پیوند دی سولفیدی (مانند اینترفرون بتا-1بی) نیازمند استفاده از یک ...

چکیده درک جزئیات تاخوردگی پروتئین اساس و پایه طراحی موفقیت آمیز مهار کننده های پروتئینی و سایر پروتئین های دارویی است. پروتئین ها فقط در صورتی عملکرد درستی دارند که شکل مطلوب را به خود بگیرند . علی رغم انجام چند دهه تحقیق و مطاالعه این سوال هنوز وجود دارد که ساختارهای عملکردی پروتئین چگونه از ساختمان اوّل پروتئین ایجاد می شوند. پاسخ به این مسأله می تواند به درک علت تعدادی از بیماری ها که حاصل...

در این مقاله یک روش طبقه بندی تغییر یافته بر مبنای روش های طبقه بندی بر اساس چگالی برای طبقه بندی تاخوردگی پروتئین ها ارائه شده است که این روش در برابر وجود نویز مقاوم بوده و از سرعت بالایی برخوردار خواهد بود. طبقه بندی پروتئین ها بمنظور پیش بینی عملکرد آنها و شناسایی خواص پروتئین ها یکی از مسائل بزرگ در حوزه طبقه بندی است. با توجه به پیشرفت علم و دستگاه های توالی یابی پروتئین های بسیاری کشف شد...

یک پروتئین، تنها به بهترین شکل در سلول اصلی خود، تحت شرایط فیزیولوژیکی خاص که در آن چندین سیستم مولکولی برای تولید کارآمد و کنترل کیفیت در مراحل مختلف از جمله سنتز، تاخوردگی و تغییرات پس از ترجمه با هم کار می‏کنند، بیان خواهد شد. ولی در حال حاضر، تولید پروتئین در کمیت و کیفیت مناسب برای اهداف درمانی یک نیاز ضروری می‏باشد. بنابراین سیستم‏های بیانی مختلف، برای تولید پروتئین نوترکیب توسعه یافتند. ...

پروتئین¬ها از حیاتی¬ترین ماکرو مولکول¬ها در طبیعت هستند که کلیه اعمال موجود زنده به عملکرد آن ها بستگی دارد. پروتئین¬ها در سوخت و ساز سلول¬ها و رشد و ترمیم بدن نقش بسیار مهمی دارند. تمام آنزیم¬هایی که در بدن باعث انجام واکنش¬های مختلف می¬شوند از جنس پروتئین هستند. پروتئین¬ها ساختاری سلسله مراتبی دارند که شامل چهار ساختار اول، دوم، سوم و چهارم می¬باشد. پیش¬بینی ساختار پروتئین¬ها از روی توالی اول...

فاکتور رشد اپیدرمی(egf) انسانی با 53 اسید آمینه و وزن مولکولی 2/6 کیلو دالتون، پروتئینی با قابلیت تحریک رشد چندین نوع سلول است و به دلیل همین ویژگی در موارد پزشکی و تهیه فراورده­ های آرایشی کاربردهای بسیاری دارد. در این پژوهش، ابتدا پلاسمید pet23a(+) حاوی ژن egf به باکتری اشرشیاکلی سویه bl21(de3) منتقل شد که سویه نوترکیب به دست آمده قادر به تولید فاکتور رشد اپیدرمی انسانی به صورت درون ریز بود. ...

فاکتور رشد اپیدرمی(EGF) انسانی با 53 اسید آمینه و وزن مولکولی 2/6 کیلو دالتون، پروتئینی با قابلیت تحریک رشد چندین نوع سلول است و به دلیل همین ویژگی در موارد پزشکی و تهیه فراورده‌ های آرایشی کاربردهای بسیاری دارد. در این پژوهش، ابتدا پلاسمید pET23a(+) حاوی ژن EGF به باکتری اشرشیاکلی سویه BL21(DE3) منتقل شد که سویه نوترکیب به دست آمده قادر به تولید فاکتور رشد اپیدرمی انسانی به صورت درون‌ریز ب...